KS-18型卡式灭菌器的工作原理有六个阶段：置换阶段、预热阶段、升温阶段、灭菌阶段、排汽阶段、干燥阶段。
1、置换阶段将水箱中的蒸馏水经加水泵注入到蒸汽发生器（功率1.2Kw，内径Φ25*90mm)内。而蒸汽发生器是电加热直喷式（容积小，加热速度快，产生蒸汽快）蒸汽发生器，产生的蒸汽随即进入灭菌盒内。此时灭菌盒内的空气在蒸汽的强行压迫下迅速经电磁法排出，将灭菌盒内的部分细菌随蒸汽一起排出，灭菌盒内温度逐渐上升，经过1分钟左右的置换阶段，电磁阀随即关闭，就进入预热阶段。
2、预热阶段程序进入预热阶段，蒸汽发生器产生的蒸汽进入灭菌盒内，将灭菌盒内器械的温度随蒸汽逐渐提高，以此来保护器械，延长器械的使用寿命。
3、温升压阶段程序进入升温升压阶段，经过预热阶段后，灭菌盒内的蒸汽聚集、膨胀，产生压力，使灭菌盒内的温度逐渐上升，当温度达到135度时，就进入灭菌阶段
4、灭菌阶段当达到灭菌温度时，程序转入灭菌阶段，灭菌盒内的物品携带的病菌等在高温蒸汽环境下很快被杀灭，灭菌计时（根据设定的灭菌时间而定，正常使用4分钟的灭菌时间既可将病菌完全杀灭）到后，排汽电磁阀打开，程序转入排汽阶段。
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