Current #160;Biol：蝙蝠体内发现SARS-CoV-2类似病毒，再次证明它是自然进化而来

2020年5月27日讯 /生物谷BIOON /——决策者和公众一直在争论导致COVID-19的SARS-CoV-2病毒的来源。尽管研究人员认为蝙蝠最有可能是SARS-CoV-2的自然宿主，但这种病毒的起源仍不清楚。近日在Current Biology杂志上，研究人员描述了一个最近发现的与SARS-CoV-2的某些基因组区域高度相似的蝙蝠冠状病毒的基因组，其刺突蛋白的亚基S1和S2的连接处包含与SARS-CoV-2高度相似的氨基酸插入。研究人员说，虽然它不是SARS-CoV-2的直接进化前体，但这种名为RmYN02的新病毒表明，这些看似不寻常的插入事件可以在冠状病毒进化过程中自然发生。
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"自从SARS-CoV-2被发现以来，已经有许多毫无根据的猜测认为该病毒来源于有实验室，"中国山东第一医科大学病原生物学研究所主任、资深作者Weifeng Shi说。"特别是，有人提出S1/S2插入是非常不寻常的，可能是实验室操作的迹象。我们的论文非常清楚地表明，这些事件在野生动物中是自然发生的。这提供了强有力的证据，证明SARS-CoV-2并非实验室来源的。"
研究人员通过分析2019年5月至10月在中国云南省收集的227个蝙蝠样本，确定了RmYN02。"自从2005年发现蝙蝠是SARS冠状病毒的宿主以来，人们就对蝙蝠作为传染病的宿主物种产生了极大的兴趣，特别是因为它们携带了非常丰富的RNA病毒，包括冠状病毒。"2020年1月初，在发现SARS-CoV-2后不久，来自样本的RNA被送往宏基因组下一代测序。
在整个基因组中，与SARS-CoV-2最接近的病毒是另一种病毒，称为RaTG13，此前在云南省的蝙蝠中发现。但在这里新发现的RmYN02病毒与SARS-CoV-2的关系更为密切，它与SARS-CoV-2在基因组的某些部分有更密切的关系，包括在基因组最长的编码段1ab中，它们共享97.2%的RNA。研究人员注意到，RmYN02在基因组中编码关键受体结合域的区域与SARS-CoV-2用来感染宿主细胞的人类ACE2受体结合的区域并不十分相似。这意味着它不太可能感染人类细胞。
SARS-CoV-2和RmYN02之间的关键相似之处在于，RmYN02在其穗状蛋白的两个亚基连接的地方也含有相似的氨基酸插入。SARS-CoV-2的特征是在S1和S2的交界处插入一个四氨基酸序列；这种插入是该病毒特有的，迄今已在所有SARS-CoV-2序列中出现。RmYN02中的插入与SARS-CoV-2中的不一样，这表明它们是通过独立的插入事件发生的。但是，在蝙蝠身上发现的一种病毒中也发生了类似的插入事件，这有力地表明，这类插入是自然发生的。"我们的研究结果表明，这些最初看起来非常不寻常的插入事件，实际上可以自然地发生在动物的beta冠状病毒中。"
"我们的工作进一步揭示了SARS-CoV-2的进化祖先，"他补充说。"无论是RaTG13还是RmYN02都不是SARS-CoV-2的直接祖先，因为在这些病毒之间仍然存在着进化差距。但我们的研究有力地表明，对更多野生物种的采样将揭示与SARS-CoV-2甚至其直系祖先关系更密切的病毒，这将告诉我们关于这种病毒如何在人类中出现的大量信息。"（生物谷Bioon.com）
参考资料：
A close relative of SARS-CoV-2 found in bats offers more evidence it evolved naturally
Hong Zhou et al， A novel bat coronavirus closely related to SARS-CoV-2 contains natural insertions at the S1/S2 cleavage site of the spike protein， Current Biology (2020). DOI： 10.1016/j.cub.2020.05.023（润宝医疗网）