英国将对10万名癌症及其他罕见疾病患者进行全基因组测序。图片提供:美国能源部
首相David Cameron在一份声明中表示,英国政府的国家医疗服务体系(NHS)已经拨款1亿英镑(约合1.6亿美元)用于这项计划。这些经费是上周宣布的未来数年6亿英镑(约合9.65亿美元)研究经费的一部分。这项测序计划预计将花费3到5年的时间。
这项计划联合了欧洲以及世界各地的多项测序计划和生物信息库。今年3月,英国官方公开了其涉及50万人的生物信息库,其中包括健康信息以及血液样本。而在2月,挪威宣布计划对1000名癌症患者的肿瘤基因组进行测序。
新公布的计划可以说是更为深远的。
在美国波士顿市马萨诸塞州总医院进行癌症遗传学研究的肿瘤学家Leif Ellisen指出:“根据这项全基因组测序的规模和范围,在我听起来感觉相当独特。”
还有其他一些全基因组测序工作正在进行当中,例如,一个在纽约进行的项目力图解码多达1000位阿尔茨海默氏症患者的基因组,但是它们在医疗目标和涉及的志愿者数量上都局限性较大。
Ellisen指出,英国研究机构面临的最大挑战将是如何把大量的DNA数据转化并生成能够帮助患者的有用信息。
在这份声明中,Cameron显得很乐观:“通过解锁DNA数据的能量,NHS将引领有关更好的测试、更好的药物,尤其是更好的护理的全球竞赛。”这份来自唐宁街十号——Cameron办公室——的声明还暗示,那10万名将基因组贡献给该计划的病人将直接从中收益——这被Ellisen称为是“一种延伸”。
迄今为止,只有少量个体从他们的全基因组测序中获益的实例,其中大部分涉及的是一些非常罕见的疾病。尽管在这种规模上进行全基因组测序“显然是做了一件非常正确的事情”,Ellisen说,“但我们并不想过多承诺”多快将会有进展出现。
全基因组测序是对一种生物的基因组中的全部基因进行测序,测定其DNA的碱基序列。目前,全基因组测序技术主要包括第二代测序技术(NGS)和第三代测序技术。第二代测序技术已经能够快速、低成本地进行全基因组测序。第三代测序技术于2011年4月正式推广,其单分子实时(SMRT)测序技术完全不同于第二代测序,它的序列读长高达3000bp(碱基对)。
《中国科学报》 (2012-12-12 第2版 国际)
(文/小编)