DNA的测序、连接和表达等操纵技术已为诸如生物燃料、化学品和医药领域带来了变革。美国能源部联合生物能源研究中心(JBEI)希望借助其j5软件包完成整个烦琐乏味的遗传操作过程。
j5软件包以云计算为基础,不仅能够设计DNA构建流程,还能够对几种方法进行比较,确定最佳途径,例如,选择将DNA构建的一部分工作外包可以降低成本。工作复杂性程度越高,j5的程序越能节省更多的时间和金钱,例如在重组文库、大量相关DNA集的收集方面。利用传统克隆方法构建一个简单的代谢途径需用时两周半,花费1400美元,而应用j5软件包可缩短至两周,且成本降低一半以上。利用传统克隆方法完成更加复杂的重组蛋白文库(243个重组子)构建任务需用时11个月,花费12.2万美元,而应用j5只需1.5个月,花费低于3万美元。
j5软件包自去年问世以来,吸引了全球250多个研究所使用,以j5为基础,为商业用户添加了模块,JBEI创建TeselaGen生物技术公司,它将显著缩短DNA合成和克隆的时间并降低成本,这是一个数十亿美元的市场。
TeselaGen公司将从以下几个方面改进j5:为商业用户建立符合ISO27001的安全云基础设施;重新设计前端用户界面;开发用于将“构建”操作流程发送给机器人的模块,以及使用户在测试后优化最终设计的模块。(丁陈君)
j5软件包以云计算为基础,不仅能够设计DNA构建流程,还能够对几种方法进行比较,确定最佳途径,例如,选择将DNA构建的一部分工作外包可以降低成本。工作复杂性程度越高,j5的程序越能节省更多的时间和金钱,例如在重组文库、大量相关DNA集的收集方面。利用传统克隆方法构建一个简单的代谢途径需用时两周半,花费1400美元,而应用j5软件包可缩短至两周,且成本降低一半以上。利用传统克隆方法完成更加复杂的重组蛋白文库(243个重组子)构建任务需用时11个月,花费12.2万美元,而应用j5只需1.5个月,花费低于3万美元。
j5软件包自去年问世以来,吸引了全球250多个研究所使用,以j5为基础,为商业用户添加了模块,JBEI创建TeselaGen生物技术公司,它将显著缩短DNA合成和克隆的时间并降低成本,这是一个数十亿美元的市场。
TeselaGen公司将从以下几个方面改进j5:为商业用户建立符合ISO27001的安全云基础设施;重新设计前端用户界面;开发用于将“构建”操作流程发送给机器人的模块,以及使用户在测试后优化最终设计的模块。(丁陈君)
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