本报讯 (记者孙国根)中外研究人员经3年多努力,合作创建了全球首个统一标准的心脏细胞器蛋白质图谱库,在心脏蛋白质组生物信息学研究方面取得重要进展。该研究把心脏生物学基础研究和临床心脏医学研究两大领域连为一体,对促进心脏转化医学研究有重要意义。相关论文近日在线发表在《循环研究》杂志上。
蛋白质是与生命及各种形式的生命活动紧密联系在一起的物质,越来越多的组学技术(基因组学、蛋白质组学和代谢组学等)研究在心血管生物领域中已广泛应用,尤其是科学家在大规模蛋白质组学研究中已发现许多以前没有发现的规律,有些规律对解释心脏细胞在生理或病理状态下的运作机制有重要意义。但蛋白质组学研究存在标识、对比参照物不统一等问题,而心脏细胞器蛋白质图谱库的建立将有助于解决这些难题。
该研究由复旦大学附属中山医院特聘教授、美国加州大学洛杉矶分校戴卫·格芬医学院心脏病学专家平琲琲教授及其研究团队,与复旦大学附属中山医院心血管病研究所葛均波院士研究团队及欧洲生物信息学研究所等合作完成。
论文共同第一作者、复旦大学附属中山医院心血管病研究所李华博士介绍,全球首个心脏细胞器蛋白质图谱库是一个全球共享平台,具有实时更新数据的功能,可将不同学科间的资源进行整理,从而有利于研究人员在特定生物背景下从事蛋白信号通路的深入研究。心脏细胞器蛋白质图谱库平台具有三大优势,一是设有很多已经整合过的重要数据,设有专为研究人员设计的宽泛、快速鉴定蛋白的搜索引擎;二是含有一个数据库和一套生物信息工具,可用来整合已知生物医学特征(如基因突变及疾病表型等);三是实时在线,有利于研究人员高效分析、上传和查询相关数据。