本报讯(记者黄明明)中山大学附属第一医院、深圳华大基因研究院等单位,联合开发了一种基于孕妇血浆DNA目标区域高深度测序,对可能携带致病性拷贝数变异(CNVs)的胎儿样本进行无创产前基因检测的方法。通过该方法,研究人员可以准确检测出胎儿是否患有地中海贫血(简称地贫)。相关成果日前发表于美国《科学公共图书馆·综合》。
对胎儿游离DNA进行大规模平行测序技术(MPS)衍生了一项新技术——无创产前检测(NIPT)。目前,这一技术对于胎儿染色体非整倍体和单碱基变异的检测都已有成功的案例,但在胎儿致病性CNVs的检测方面鲜有报道。
此次研究小组共对5组患有SEA缺失型α-地中海贫血的夫妇样本(包括夫妇双方的全血和孕妇血浆)进行了基因组测序及分析。同时,以12例正常人样本数据为参照,并收集胎儿羊水样本进行了结果验证。研究结果与羊水检查结果及临床诊断结果完全一致。这证实新开发的无创产前致病性CNVs检测方法,可准确检测出胎儿是否患有α-地中海贫血。
据介绍,地中海贫血是全球高发性单基因遗传病,其中重型α-地贫患儿在胎儿时期或出生不久后死亡,重型β-地贫出生后须定期输血并接受除铁剂治疗。中国长江以南为地贫高发区域,其中广东、广西、海南及云南的地贫发生率居全国之首,平均携带率高达10%~20%,并以缺失型的α-地贫最为多见,占70%以上。
新开发的无创产前致病性CNVs检测方法,首次采用高通量捕获测序成功对常染色体隐性遗传病进行检测,不仅在无创产前单基因病检测方面实现了新突破,更使无创产前地中海贫血检测成为可能。相较于传统的筛查方法,该方法可大大提高检测的安全性。如果大众都能在婚前、孕前和产前做好地贫基因检查的工作,将可降低中、重型地贫发病率。