目前，有不少人对褪黑素的应用存在误区，把它看成了一种万能补品，随便滥用。甚至还有人把它当作礼品送给“坐月子”的产妇补身体。卫生部对这类产品的批文认为，褪黑素在中年以后随着年龄的增长在体内的含量愈来愈少，适时补充可以调整人体生物节律，改善睡眠状况。但适宜人群为中老年人;不适宜青少年、孕妇及哺乳期妇女、自身免疫性疾病患者及抑郁型精神病患者。
有关专家认为，这类制剂只能改善睡眠和润肠通便，而没有延缓衰老、改善性功能、提高免疫力、美容等众多功效，儿童、孕妇、乳母均不宜服用。患有自身免疫性疾病，如风湿和类风湿关节炎、红斑狼疮、某些肾炎者不宜服用，患有抑郁型精神病，如老年抑郁症者也不宜服用。目前卫生部除肯定了褪黑素有改善睡眠的作用外，其余保健作用均未认可。
另有医学研究证明，如果过多服用褪黑素，可能会导致人体内的甲状腺素、肾上腺素的浓度相对降低。而这两种物质是促使细胞积极工作的激素，一旦减少，细胞就会“偷懒”，变得不活跃，使人因疲倦欲睡。此时开车往往容易注意力分散，反应力减弱，敏感度降低，从而导致交通事故的发生。因此，驾车、机械作业及从事危险操作者均应慎用。
美国一家研究机构研究证明，健康的老年人和年轻人一样，体内可产生同样水平的褪黑素，因此，健康老年人也不应随便乱服褪黑素。还有研究认为，服用高剂量褪黑素有增加中风的危险。因此，除睡眠较差的中老年人可适当试服这类制剂外，健康老人及其他人群切记不要滥用。
